La pollinisation d'une fleur d'orchidée consiste à féconder une fleur de celle ci. On commence par prélever dans la colonne protégée par l'opercule les pollinies (sacs de pollen) qui sont de nombres différents selon les espèces. Puis on dépose ces pollinies  sur le stigmate (parti creuse et renfermant un liquide gluant sous la colonne) d'une autre fleur. On constate que quelques heures après la fécondation la colonne se referme, enfermant les pollinies. Puis il faut attendre quelques mois (nombre de mois variable selon les espèces) que la capsule se forme. Lorsque la capsule ainsi formée, arrive à maturité, celle ci s'ouvre libérant les graines. Après récupération de ces graines il ne reste plus cas les faire germer, pour ceci la méthode qui convient le mieux et la culture in vitro. Malheureusement  dans certains cas la capsule arrivée à maturité peut se révéler être vide ou présentant des graines stériles.

Opercule et pollinies.

Capsule en maturation d'un croisement phalaenopsis bellina par phalaenopsis equestris vu de coté.

Capsule arrivée à maturité et qui s'ouvre d'un croisement de phalaenopsis lindenii par phalaenopsis equestris rosea.

 Capsule ouverte avec ses graines provenant d'un croisement entre doritis.

 Légende d'une fleur de phalaénopsis